Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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