Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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