Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD3Q15054 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
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