Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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