Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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