Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms