Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms