Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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