Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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