Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CBX3Q13185 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CBX3Q13185 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CBX3Q13185 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CBX3Q13185 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CBX3Q13185 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CBX3Q13185 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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