Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP4Q09028 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms