Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms