Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNA1P78396 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms