Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms