Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTR3P61158 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms