Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCT3P49368 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCT3P49368 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCT3P49368 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCT3P49368 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT3P49368 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms