Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A3P48764 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A3P48764 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A3P48764 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms