Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA1P42261 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms