Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPOP42166 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPOP42166 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPOP42166 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms