Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGP37231 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGP37231 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGP37231 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGP37231 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGP37231 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGP37231 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGP37231 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGP37231 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGP37231 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGP37231 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGP37231 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms