Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC1P35052 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms