Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms