Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms