Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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PDE6GP18545 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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PDE6GP18545 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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PDE6GP18545 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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PDE6GP18545 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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PDE6GP18545 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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PDE6GP18545 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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PDE6GP18545 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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PDE6GP18545 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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