Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSP16219 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSP16219 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms