Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms