Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI2P10070 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI2P10070 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI2P10070 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI2P10070 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI2P10070 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI2P10070 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI2P10070 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI2P10070 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI2P10070 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI2P10070 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI2P10070 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI2P10070 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI2P10070 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI2P10070 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI2P10070 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI2P10070 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI2P10070 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI2P10070 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI2P10070 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI2P10070 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI2P10070 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI2P10070 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI2P10070 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI2P10070 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI2P10070 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI2P10070 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI2P10070 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI2P10070 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI2P10070 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI2P10070 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI2P10070 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI2P10070 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI2P10070 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI2P10070 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI2P10070 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI2P10070 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI2P10070 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI2P10070 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI2P10070 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI2P10070 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI2P10070 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI2P10070 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI2P10070 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI2P10070 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI2P10070 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI2P10070 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI2P10070 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI2P10070 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI2P10070 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI2P10070 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI2P10070 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI2P10070 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI2P10070 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI2P10070 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI2P10070 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI2P10070 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI2P10070 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI2P10070 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI2P10070 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI2P10070 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI2P10070 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI2P10070 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI2P10070 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI2P10070 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI2P10070 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI2P10070 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI2P10070 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI2P10070 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI2P10070 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI2P10070 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI2P10070 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI2P10070 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI2P10070 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI2P10070 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI2P10070 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI2P10070 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms