Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOL3O60936 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOL3O60936 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOL3O60936 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOL3O60936 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOL3O60936 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOL3O60936 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOL3O60936 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOL3O60936 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOL3O60936 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOL3O60936 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOL3O60936 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOL3O60936 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOL3O60936 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms