Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN34H7C241 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms