Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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SH3BP1Q9Y3L3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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SH3BP1Q9Y3L3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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SH3BP1Q9Y3L3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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SH3BP1Q9Y3L3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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SH3BP1Q9Y3L3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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