Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRPF3Q9ULD4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRPF3Q9ULD4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BRPF3Q9ULD4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRPF3Q9ULD4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRPF3Q9ULD4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BRPF3Q9ULD4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRPF3Q9ULD4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRPF3Q9ULD4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BRPF3Q9ULD4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRPF3Q9ULD4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
BRPF3Q9ULD4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
BRPF3Q9ULD4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms