Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms