Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms