Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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