Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID1IP1Q9NPA3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID1IP1Q9NPA3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms