Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F12Q9HCS2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP4F12Q9HCS2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP4F12Q9HCS2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP4F12Q9HCS2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP4F12Q9HCS2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP4F12Q9HCS2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP4F12Q9HCS2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP4F12Q9HCS2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP4F12Q9HCS2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP4F12Q9HCS2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP4F12Q9HCS2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F12Q9HCS2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms