Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMURF2Q9HAU4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms