Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX2Q99697 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PITX2Q99697 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PITX2Q99697 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX2Q99697 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX2Q99697 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX2Q99697 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX2Q99697 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PITX2Q99697 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX2Q99697 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX2Q99697 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX2Q99697 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PITX2Q99697 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PITX2Q99697 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX2Q99697 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms