Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms