Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCLNQ969V3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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