Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms