Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms