Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms