Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms