Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms