Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms