Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms