Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RWDD4Q6NW29 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms