Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms