Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms